随着高通量测序技术的迅猛发展，转录组分析逐渐发展成为一项基础的研究方法在生物学个领域得到广泛的应用。

在转录组分析入门的过程中，您是否遇到这样的问题：看了一篇篇的入门干货，依然无从下手；因缺少数据分析的环境，空有一肚子的理论无法实践；按照教程一步步实践，可就是无法产生相同的结果；面对种类繁多的数据挖掘工具，应该怎么选择？

为了方便大家学习，华大基因学院特推出《转录组入门实操专题》课程，本次课程由经验丰富的一线讲师坐镇，理论知识与上机实操双管齐下，从零基础到实战，手把手带您掌握转录组入门实操。

时间：2020年4月24日-28日

培训地点：远程在线

注：可回放

一、培 训 对 象

生物信息入门阶段的学员

有转录组项目的学员

二、授 课 形 式

直播授课 + 社群辅导 + 直播答疑 + 1v1在线指导操作

1次培训搞定转录组入门实操，你想要的都在这里！

三、课 程 特 色

一站式课程

提供稳定的转录组分析环境；

系统的讲解从测序下机数据开始直到数据挖掘的整个过程及所使用的最优软件；

一流的讲师

依据丰富的项目实践经验，为您讲解转录组项目设计过程考虑的关键问题、操作过程中常见的错误及解决方案

全方位课程辅导

课前：提供社群辅导；

课间：在直播间为您答疑；

课后：设置专门的操作练习时间并配助教实时答疑；

专属课程福利

提供华大内部自编上机实操手册

赠送3门视频课程，供课前预习并提供社群辅导

赠送操作所需全部代码

提供1v1远程指导，吃透每一个实操步骤

四、课 程 安 排

课前预习

视频课程+社群辅导

《Linux基础知识》

《R语言基础知识》

《二代测序原理》

第1天

《转录组基础及前沿进展》

2020年4月24日（周五） 19:00-21:00

转录组测序技术概述

转录组项目设计要点（样本数/测序量/测序读长/测序平台）

转录基本产品和内容介绍（无参/有参转录组/非编码RNA)

常用数据库介绍

（NCBI/Ensembl/Genconde/KEGG/GO/Genecards）

新技术与新方向（三代全长转录组/高通量单细胞RNA-Seq)

第2天

《转录组数据基本分析》

2020年4月25日（周六） 9:30-11:30

测序数据过滤和质控

有参转录组序列比对（Hisat2的使用）

基因表达定量（StringTie的使用）

基因差异表达分析（DEseq2的使用）

功能注释和GO/pathway的分类

富集分析（ClusterProfiler包的使用）

可视化IGV的使用

Excel实战分析

第2天

在线操作练习及答疑

2020年4月25日（周六） 18:00-20:00

直播答疑，重点击破实操练习遇到的重难点

1v1远程指导，吃透每一个实操步骤

第3天

《lncRNA测序数据分析》

2020年4月26日（周日） 9:30-11:30

lnRNA生物学基础及应用

转录本拼接（StringTie的使用）

转录本去冗余（cuffcompare/gffcompare的使用）

lncRNA的鉴定（getorf/CPC2)

lncRNA与mRNA的互作分析

lncRNA与miRNA的互作分析(psRobot的使用）

lncRNA分析实例

第3天

在线操作练习及答疑

2020年4月26日（周六） 19:00-21:00

直播答疑，重点击破实操练习遇到的重难点

1v1远程指导，吃透每一个实操步骤

第4天

《miRNA测序数据分析》

2020年4月27日（周六） 9:30-11:30

miRAN生物学基础及应用

miRNA测序数据分析过程

miRNA的定向和定量（bowtie比对/balst比对）

miRNA的差异分析（DEGseq/DEseq2的使用)

miRNA靶基因预测

(

psRNAtarget/TargetScan/mirnada/RNAhybrid的使用)

miRNA功能分析

miRNA-mRNA关联分析

cytoscape软件的使用

第4天

在线操作练习及答疑

2020年4月27日（周日） 19:00-21:00

直播答疑，重点击破实操练习遇到的重难点

1v1远程指导，吃透每一个实操步骤

第5天

《转录数据深度挖掘》

2020年4月28日（周二） 15:00-17:00

WGCNA共表达分析

GSEA富集分析

时间序列分析

转录因子分析

五、讲 师 介 绍

注：讲师按照姓氏首字母排序

孙 海 汐

华大生物信息副研究员，中国科学院遗传与发育生物学研究所博士，美国洛克菲勒大学进行博士后。深圳市海外高层次人才”和“深圳市盐田区高层次人才。主要从事长链非编码RNA的功能研究，发表SCI研究论文11篇，累计影响因子84，引用500余次，发表生物信息方法学著作1章，申请专利2项、软著3项。

谢 洪 青

华大科技资深信息分析工程师，2011年加入华大，目前就职于华大基因科技服务有限公司数据交付部门，主要从事小RNA和重测序项目的开发和交付工作。有丰富的数据分析经验和项目经验。

徐 婧

华大科技资深信息分析工程师，具有丰富的转录组项目经验，多年从事生物信息分析。对转录组研究的数据挖掘，工具和软件的使用，项目设计，数据解读，文章撰写的思路有深入的了解。多次协助客户发表高分文章。

袁 永 娴

高级研发经理，毕业于香港中文大学，2011年加入华大，目前就职于华大股份科技服务研发部，从事转录组与单细胞产品的研发工作，主要研究方向为：基因表达定量、转录本结构鉴定、细胞分群、调控网络构建等，发表过多篇sci文章，有丰富的数据分析经验和项目经验。

六、报 名 方 式：详见华大基因学院